在今年7月間爆發的國安局私菸案引發極大關注，國安局少校吳宗憲等人在陪同總統蔡英文「自由民主永續之旅」出訪期間利用職務之便進行香菸走私，事件爆發後引發界撻伐；台北地檢署23日偵結，全案進入台北地方法院審理，台北地院26日召開移審庭，吳宗憲表示，他身為中華民國軍人，只是執行長官的指令，認為自己無罪。
國安私菸案台北地檢署23日偵結，全案進入台北地方法院審理。由於國安局少校吳宗憲、張恒嘉2人目前仍遭羈押，移審台北地方法院後，北院於晚間8點召開接押庭。開庭時，吳宗憲陳述4大重點，強調他身為中華民國職業軍人，他只是做好長官交付的任務，也知道不合法的事情不能執行，盼法官還他清白，給與公平的審判。
綜合相關報導，當法官問對於檢察官起訴內容有何意見，是否認罪？吳宗憲說「不承認！我認為我是無意犯罪。」他說，有前輩和前例，他認為都是合法的「長官交辦任務，應該也是合法的。」
吳宗憲還說，華航給的商品目錄、訂購單、價格表等，他都完全公開給同仁和親友，沒有任何抽取報酬的意思「我身為中華民國職業軍人，我只是想做好長官交付的任務，也知道不合法的是不能去執行的，盼法官給予公平審判，還給我一個清白。」
對此，有網友認為吳宗憲的說法是「無恥、太可笑！超過兩條煙就算走私，根本貪污瀆職要重判無期徒刑才對」、「國安局的還真沒知識，最好長官叫你做啥都是合法」、「幾歲了…任職國安局的講這種理由誰信？」、「你說出訪有特別禮遇而多帶個4、5條也就算了，你們現在是帶約1萬條菸耶，這已經是蓄意謀利了，你還說這樣沒罪？如果輕放的話，以後大家出國都可以免稅品隨便帶了」。
但也有另一派網友認為吳宗憲說的沒錯「服從是軍人的職責，下令的才是要抓出來的！」、「我認同他無罪！他在這個職務上不服從長官可以嗎？有罪的人吃香喝辣、遮遮掩掩，這就是台灣的政治」、「哪位長官？不要官官相護！」、「哪個長官？就明白說出來啊…」、「辦案要有良知啊！㧓出真正主事者！」、「長官已經被記過調職了，但是過陣子等風聲退了，再給長官更高職位作為犒賞」、「大選到了，他不扛誰扛？」(李遊博/綜合報導)
