同婚釋憲案在24日登場，法務部長邱太三在言詞辯論時舉例，同婚修法後可能會出現祖先牌位要寫「考考妣妣」的問題，未料引發議論，《聯合報》27日的社論更以此為主題批評邱太三以「考考妣妣」反對同婚，且未以部長高度談論人權與宗教衝突等核心議題。
《聯合報》在社論中寫道，未來，人們想起台灣的同志婚姻釋憲案，法務部長邱太三恐將以「妣考邱」贏得奇異的歷史定位。邱太三身為內閣法務首長，在憲法法庭辯論，選擇以祖宗稱謂「考考妣妣」的民俗衝擊表示反對，卻未以部長的高度論及法律調適、人權與宗教的衝突等核心議題。這不僅令人對政府閣員的素質憂心，若邱太三的發言代表了政府的態度，那就更坐實蔡政府已成「騙票」政權。
對此，邱太三27日親上火線澄清，記者會背板還寫著「惡意攻訐，絕不妥協」，他強調報社媒體當然本身可以有他的立場也可以有他的態度，但是最重要的，他絕對不能顛倒是非、惡意的指摘或者是睜眼說瞎話。
法務部也發出新聞稿，強調「法務部部長於憲法法庭辯論明確論及法律、人權與宗教自由等核心議題」。法務部說，對此惡意攻訐，絕不妥協！
法務部在聲明中強調，關於邱太三部長於憲法法庭述及傳統民俗稱謂用語乙節，乃係就聲請人台北市政府訴訟代理人詢問修改民法承認同性婚姻，是否有影響社會秩序及公共利益之具體事例，而轉述周遭親友所詢之生活事實現狀，並未以此為由，反對同性團體追求幸福。
另外，法務部指出，邱太三部長於辯論過程中，曾詢問鑑定人「當婚姻自由跟宗教、學術及契約自由等憲法保障之價值產生衝突時，該如何兼顧？」等人權與宗教自由衝突議題，俾供討論，惟未獲回應。
邱太三部長於最後陳述時，再次提出同性婚姻自由對於宗教自由、思想自由及契約自由，可能會發生衝突，例如神職人員可否拒絕為同性伴侶證婚？有無提供舉行結婚儀式場所之義務？或是遊覽車司機可否拒絕搭載挺同人士來台北參加遊行？等亟待釐清之問題。「至媒體所指法務部部長未論及此等問題，應係未觀看辯論全程而為之錯誤論述」。
最後，法務部再度重申，法務部絕對不會反對、阻擋任何追求幸福的權利，不論係組織家庭人格權利或其他權利，只要不與其他憲法所保障基本權價值產生衝突，法務部均採開放態度，也相信透過立法過程中充分討論，一切都能水到渠成（李遊博／綜合報導）
